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Virologie

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Caractérisation et impact du microbiote bactérien respiratoire sur les maladies virales Volume 22, numéro 3, Mai-Juin 2018

Illustrations

  • Figure 1
  • Figure 2
  • Figure 3

Tableaux

Auteurs
Centre hospitalier universitaire de Lyon, Laboratoire de virologie, Institut des agents infectieux (IAI) de Lyon, Centre national de référence des virus respiratoires France Sud, Centre de biologie et de pathologie Nord, Groupement hospitalier Nord F-69317, Lyon cedex 04, France
Université Claude Bernard Lyon 1, Faculté de médecine Lyon Est, CIRI, ENS, Inserm U1111 CNRS UMR5308, équipe Virpath, F-69372, Lyon cedex 08, France
* Tirés à part

Longtemps considéré comme stérile, le tractus respiratoire est maintenant reconnu comme un espace comportant un microbiome à fort potentiel évolutif. L’amélioration des technologies de séquençage permet désormais l’étude de la physiopathologie du microbiome bactérien respiratoire et de ses liens avec la sévérité des infections virales respiratoires. Après une revue des méthodes de caractérisation du microbiote bactérien, en général, et respiratoire, en particulier, cette revue s’attachera à décrire l’impact de ce microbiote sur l’immunité innée et acquise de l’hôte infecté. Nous verrons comment l’exposition virale, survenant dans un contexte d’altération ou de déplétion totale du microbiote respiratoire après antibiothérapie, influence fortement l’évolution clinique de l’hôte infecté. La prise en charge des patients infectés, à risque de complications, pourrait bénéficier de ces nouvelles connaissances. En effet, des études récentes démontrent que de nombreuses voies de réponse de l’hôte à l’infection sont perturbées lorsque le microbiote bactérien est altéré. Son rééquilibrage, par administration de probiotiques ou de molécules innovantes modifiant sa composition, pourrait améliorer le pronostic de l’infection.

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