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Virologie

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Rhinovirus : diversité clinique et génomique Volume 12, numéro 5, Septembre-Octobre 2008

Auteurs
Laboratoire de virologie, service des maladies infectieuses, hôpitaux universitaires de Genève, 24, Rue Micheli-du-Crest, 1211 Genève, Switzerland

Le rhinovirus est la première cause virale d’infections des voies respiratoires et cela à travers toutes les classes d’âge, du nouveau-né au patient très âgé. Le caractère bénin de la plupart de ces infections ainsi que les difficultés à en isoler l’agent ont limité notre perception de son impact clinique. L’usage d’outils diagnostiques moléculaires a permis de mieux caractériser la diversité des présentations cliniques qui ne se limitent pas au simple rhume. Il est dorénavant clairement établi que le rhinovirus est capable d’infecter l’arbre respiratoire supérieur et inférieur qui est aussi le siège d’une réplication virale. De plus, ce virus est la cause de complications significatives chez les sujets à risque tels que les asthmatiques ou les patients souffrant d’immunodéficience. L’utilisation de méthodes de screenings moléculaires démontre une très grande diversité des souches circulantes qui ne se limite pas aux sérotypes connus et a permis d’identifier de nouveaux sous-groupes jusqu’à présent ignorés. L’analyse détaillée de l’organisation génomique des rhinovirus démontre une phylogénie commune entre certains sous-groupes de rhinovirus et les entérovirus et illustre les contraintes façonnant l’évolution des Picornaviridae humains. Ainsi l’étude des structures CRE démontre que pour chaque espèce cette structure est non seulement conservée mais aussi localisée sur un gène spécifique à chacune de ces espèces. Ces dernières sont donc identifiables par la localisation de cette structure secondaire.