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Annales de Biologie Clinique

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Comparaison de deux RT-PCR SARS-CoV-2 et impact du logiciel de l’instrument sur la valeur du Ct Volume 80, numéro 6, Novembre-Décembre 2022

Illustrations


  • Figure 1

  • Figure 2
Auteurs
on behalf of the SARS-CoV-2 Foch Hospital study group
1 Service de biologie clinique, Hôpital Foch, Suresnes, France
Correspondance : E. Farfour

La valeur du cycle seuil (Ct) des RT-PCR positives pour le SARS-CoV-2 est utilisée pour évaluer si un patient est contagieux. Lors d’un changement de réactif, nous avons comparé les résultats de Ct obtenus pour 45 prélèvements positifs pour le SARS-CoV-2 avec 2 kits de réactifs : Alinity M SARS-CoV-2 et Alinity M RESP-4-Plex (Abbott Molecular, Des Plaines, Illinois, États-Unis) utilisée avec l’automate Alinity M. Les deux méthodes était corrélées mais les Ct étaient en médiane plus bas de 4,54 avec le réactif Alinity M RESP-4-Plex en comparaison du réactif Alinity M SARS-CoV-2. Cette différence semble liée à une détection plus précoce de la positivité par le logiciel de l’Alinity M qu’à une différence de performances. Nous alertons sur le fait que les valeurs de Ct doivent être interprétées avec prudence en prenant en compte le contexte clinique, les limites pré-analytiques et analytiques.