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Annales de Biologie Clinique

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Comparaison de l’utilisation en routine de deux milieux chromogènes ChromID CPS® (bioMérieux) et UriSelect4® (Bio-Rad) pour la détection d’Escherichia coli et des principaux uropathogènes dans les urines Volume 72, numéro 2, Mars-Avril 2014

Illustrations


  • Figure 1

  • Figure 2

Tableaux

Auteurs
Plateau technique de microbiologie, Laboratoire de bactériologie, CHU Strasbourg, France
* Tirés à part

Escherichia coli est le pathogène le plus fréquemment isolé dans les urocultures. Son identification rapide et spécifique représente donc un enjeu majeur dans le délai de rendu de résultats et l’optimisation de la prise en charge du patient. L’objectif principal de ce travail a été de comparer les performances d’identification présomptive d’E. coli de deux géloses chromogènes, ChromID CPS® (Biomérieux) et UriSelect4® (Bio-Rad), sans réalisation de tests complémentaires. Un total de 99 urines consécutives et non redondantes de patients suspects d’infection urinaire ont été ensemencées en parallèle sur gélose au sang et sur les deux géloses chromogènes. La quantification et la couleur des colonies observées ont été évaluées à 18 et 48 h puis ces identifications présomptives ont été comparées aux résultats d’identification obtenus par spectrométrie de masse. Dans un 2e temps, 80 souches bactériennes sélectionnées pour poser potentiellement des problèmes d’identification sur milieux chromogènes ont été analysées. Parmi les 99 urines analysées, 42 des 43 urines positives à E. coli étaient correctement colorées en rose sur les deux milieux (sensibilité = 97,7 %). Le dénombrement bactérien a été significativement plus faible sur les milieux chromogènes par rapport à la gélose au sang (p < 0,001). L’analyse complémentaire des 80 souches a montré des problèmes de spécificité avec la gélose UriSelect4® : certaines souches de Citrobacter freundii, ainsi que de Citrobacter brakii, Enterobacter cloacae et Hafnia alvei ont été colorées en rose, portant à confusion avec E. coli. Ces problèmes n’ont pas été retrouvés avec le milieu ChromID CPS®. En conclusion, la gélose ChromID CPS® s’est révélée dans notre travail être supérieure à la gélose UriSelect4® en termes de spécificité d’identification directe d’E. coli, sans utilisation de test complémentaires.