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Evaluation des VNTR (variable number of tandem repeats) des isolats de Mycobacterium bovis en Algérie


Annales de Biologie Clinique. Volume 68, Numéro 4, 449-53, juillet-août 2010, article original

Texte intégral   Summary  

Auteur(s) : Naima Sahraoui, Borna Muller, Yala Djamel, Boulahbal Fadéla, Ouzrout Rachid, Zinsstag Jakob, Guetarni Djamel

Résumé : Le pouvoir discriminant des VNTR (variable number of tandem repeats) basé sur 7 loci (MIRU 26, 27 et 5 ETR A, B, C, D et E) a été évalué sur des souches de Mycobacterium bovis isolées à partir de prélèvements d'organes recueillis pour suspicion de tuberculose dans deux abattoirs du centre de l'Algérie. La technique de MIRU-VNTR a été évaluée sur 88 souches de M. bovis et une souche de M. caprea et a montré 41 profils différents. Les résultats obtenus ont révélé que les VNTR étaient hautement discriminatoires avec une diversité allélique de 0,930 où quatre loci (ETR A, B, C et MIRU 27) étaient très discriminants (h > 0,25) et trois loci (ETR D, E et MIRU 26) modérément discriminants (0,11 <\; h <\; 0,25). Les VNTR des quatre loci hautement discriminatoires se sont avéré être appropriés pour la première différenciation des souches de M. bovis en Algérie. La technique des VNTR s'est révélée être un précieux outil pour la poursuite du développement et de l'application de recherche épidémiologique de la transmission de la tuberculose en Algérie.

Mots-clés : abattoir, Mycobacterium bovis, VNTR, diversité allélique, Algérie

 

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