JLE

Annales de Biologie Clinique

MENU

Aide numérique à l’identification bactérienne : définition d’un risque d’erreur alpha Volume 64, numéro 1, Janvier-Février 2006

Auteur
Haute école Charleroi-Europe, site de l’ISC-Fleurus, Fleurus, Belgique

Le mode de calcul habituellement utilisé en support de l’identification bactérienne se révèle efficace dans son rôle premier, qui est de proposer le nom des bactéries plausibles, mais il échoue dans la définition d’un niveau de confiance qui puisse être associé à l’éventuelle décision. Pour corriger ce défaut, l’article propose de calculer l’ensemble des distributions de probabilité de réponse pour chaque bactérie. Ce calcul utilise la méthode dite de Monte-Carlo et doit être effectué une fois pour toutes sur une galerie donnée. Sur chacune de ces distributions, il est aisé de repérer un niveau de risque d’erreur de première espèce, ou risque d’erreur alpha. L’approche théorique proposée évite par ailleurs la comparaison de scores d’identification, comparaison qui pose question dès lors que les différentes bactéries présentent des sensibilités très différentes aux tests biochimiques.