Home > Journals > Public health > Cahiers d'études et de recherches francophones / Santé > Full text
 
      Advanced search    Shopping cart    French version 
 
Latest books
Catalogue/Search
Collections
All journals
Medicine
Biology and research
Public health
Cahiers d'études et de recherches francophones / Santé
- Current issue
- Archives
- Subscribe
- Order an issue
- More information
Agronomy and biotech.
My account
Forgotten password?
Online account   activation
Subscribe
Licences IP
- Instructions for use
- Estimate request form
- Licence agreement
Order an issue
Pay-per-view articles
Newsletters
How can I publish?
Journals
Books
Help for advertisers
Foreign rights
Book sales agents



 

Texte intégral de l'article
 
  Printable version

Investigation of a shigellosis outbreak in a rural zone of Senegal


Cahiers d'études et de recherches francophones / Santé . Volume 11, Number 4, 217-9, Oct. - Nov. - Décembre 2001, Etudes originales


Résumé   Summary  

Author(s) : Aldiouma Diallo, Mohamed Boss Diop, Mohammed Moctar Gueye, Jean-François Etard, Centre IRD, BP 1386, Dakar Hann, Sénégal..

Summary : The investigation of this outbreak took place in Niakhar (IRD project study area), a rural area located 150 km East of Dakar. Covering 30 villages, with a population of about 30,000 inhabitants, the area has been under demographic and epidemiological surveillance. In 1999, the surveillance allowed 973 cases of shigellosis to be recorded out of 1,751 cases of dysenteric diarrhoeas. The outbreak reached a peak during the raining season (73% of the cases in September and October). All the villages and all age groups were concerned. The attack rate in the population was 3%. During the same period, 22 deaths were attributed to shigellosis, leading to a lethality of 2.3%. Children under five were the most affected. The bacteriological examination isolated S. flexneri in 72% of 12 stools samples and S. dysenteriae A1 (SD1) in 14%. All serotypes were resistant to ampicillin and susceptible to quinolones. Susceptibility to cotrimoxazole was unconstant. Apart from the usual factors involved in the spread of diarrhoeas, the main reason evoked to explain the duration of the epidemic has been the lack of adequate emergency antibiotherapy treatment. Quinolones, recommended by the health authorities, could not be provided by health services. The identification of the SD1 serotype confirmed its involvement in the outbreak of shigellosis. The exact role of S. flexneri in shigellosis epidemics should be further studied.

Pictures

ARTICLE

Depuis 1998, le Sénégal connaît des flambées épidémiques de diarrhées glairo-sanglantes, surtout pendant la saison pluvieuse [1]. La zone de Niakhar, en milieu rural, dans la région de Fatick n'a pas été épargnée. Au cours de l'année 1999 et notamment à partir du mois de mai, une augmentation considérable des cas de dysenterie a été observée dans les villages de la zone. Une analyse ponctuelle des registres des dispensaires a montré que, pendant le mois d'août, les dysenteries ont représenté 15 % des motifs de consultation. En période endémique, cette proportion varie entre 3 et 5 %. Une investigation a été proposée et mise en œuvre pour confirmer l'épidémie et la décrire dans la zone pendant l'année 1999. Par ailleurs, Shigella flexneri et Shigella dysenteriae ont été isolées dans 12 échantillons de selles prélevés chez des malades présentant des diarrhées dysentériques entre mai et novembre 1999 [2].

Population et méthode

Population d'étude

La zone de Niakhar couvre 30 villages avec deux postes de santé publique à Toucar et Ngayokhème et un poste de santé privé, catholique, à Diohine pour une population d'environ 30 000 habitants. Cette population fait l'objet d'un suivi longitudinal par une équipe de l'IRD (ex-ORSTOM) depuis 1983. Dans ce cadre, le recensement de la population et des événements vitaux survenant dans la zone a été réalisé tous les ans de 1983 à 1987, puis toutes les semaines jusqu'en février 1997, la fréquence étant ensuite devenue trimestrielle.

Système de surveillance épidémiologique

Entre novembre 1999 et janvier 2000, deux systèmes de notification des cas de dysenterie ont été mis en place. Un cas suspect de shigellose a été défini par la survenue d'une diarrhée glairo-sanglante et fébrile durant cette période chez un individu présent dans la zone au début de l'épisode morbide. Le premier système a consisté, lors du passage des enquêteurs dans les concessions dans le cadre du suivi de la population, à répertorier l'ensemble des cas répondant à cette définition. En plus des signes cliniques, ce système de notification s'est intéressé aux données démographiques des sujets atteints, à la date du début des symptômes, au recours aux dispensaires et à l'issue de la maladie. Le second système a recueilli de façon rétrospective, à partir des registres des trois postes de santé de la zone, tous les cas de diarrhées glairo-sanglantes.

Prise en charge des cas

Le protocole thérapeutique recommandé par le service national des grandes endémies à partir des antibiogrammes des premiers prélèvements préconisait l'utilisation de la ciprofloxacine (500 mg 2 fois par jour), qui était en principe disponible à la Pharmacie nationale d'approvisionnement (PNA) [1]. Le suivi thérapeutique a été évalué à partir des données des registres des dispensaires.

Examens de laboratoire (Institut Pasteur de Dakar)

Des prélèvements de selles ont été réalisés pour certains malades. Ces prélèvements ont été maintenus à la température ambiante et envoyés dans les 24 heures qui ont suivi leur recueil au laboratoire de bactériologie de l'Institut Pasteur de Dakar. Tous les prélèvements (12 au total) ont fait objet d'une culture et d'un antibiogramme.

Traitement et analyse des données

Deux fichiers ont été obtenus à partir des deux principaux systèmes de recueil. Seuls les résidents de la zone de Niakhar pour l'enquête domiciliaire ont été retenus pour cette analyse de même que les consultants des trois postes de santé. La saisie et l'analyse des données ont été réalisées avec les logiciels Visual Fox Pro et Epi-Info.

Résultats

Au cours de l'enquête domiciliaire, 973 cas suspects de shigellose sur 1 751 diarrhées dysentériformes ont été répertoriés. La courbe épidémique montre une acmé de l'épidémie en septembre et octobre bien que des cas aient été recensés durant toute l'année (figure). Tous les villages et toutes les tranches d'âge ont été atteints (tableau 1). Le taux d'attaque dans la population a été de 3 %. Vingt-deux décès ont été enregistrés avec une létalité de 2,3 % (tableau 2). L'étude rétrospective (aux dispensaires) a permis d'identifier 1 062 cas avec un profil épidémiologique comparable aux résultats de l'enquête communautaire. Le métronidazole (43 %), le cotrimoxazole (42 %), l'ampicilline et la tétracycline ont été à la base de la prise en charge thérapeutique des cas au niveau des trois dispensaires de la zone.

L'examen bactériologique effectué sur les 12 prélèvements a permis d'isoler S. flexneri dans 72 % des cas, S. dysenteriae A1 (SD1) dans 14 % des cas et E. coli dans les autres cas. La sensibilité aux quinolones a été constante pour toutes les souches. Elle a été, en revanche, variable pour le cotrimoxazole, avec une sensibilité effective sur 50 % des S. flexneri mais nulle pour l'autre moitié et sur S. dysenteriae.

Toutes les souches ont présenté une nette résistance à la tétracycline et l'ampicilline.

Discussion

Ces données montrent l'éclosion d'un phénomène épidémique dans la zone de Niakhar au cours de l'année 1999. Par ailleurs, un nombre important de cas de dysenterie avait déjà été observé au cours de l'année 1998 [1]. Ce nombre n'a pas été estimé mais la réapparition de cas en 1999 avec un taux d'attaque de 3 %, peu élevé comparativement à celui des épidémies décrites en Afrique du Sud, au Rwanda et au Burundi, permet de considérer qu'on est en présence d'un phénomène épidémique récidivant [3, 4].

Tous les villages ont été touchés, avec une nette prépondérance de cas dans les villages où sont implantés les trois principaux postes de santé et les hameaux environnants (46 %), de la même façon que lors de l'épidémie du choléra à Niakhar en 1995-1996 [5]. Cette distribution géographique, temporelle et des cas index au niveau des concessions suggère une transmission de personne à personne. La surveillance épidémiologique à partir de l'enquête communautaire a permis de déterminer l'ampleur de l'épidémie, notamment durant la saison pluvieuse (73 % des cas entre septembre et octobre). Malgré la symptomatologie bruyante de la maladie, 44 % seulement des patients - dont 62 % chez les 0-4 ans - ont eu recours au dispensaire. La létalité chez les enfants âgés de moins de 5 ans était comparable à celle des enfants en Afrique du Sud, au Rwanda et au Burundi durant les épidémies de shigellose [3, 4].

Le phénomène épidémique a été observé en 1998 et en 1999 durant toute l'année. Une des raisons évoquées pour expliquer la longueur de l'épidémie, en dehors des différents facteurs connus dans la diffusion des diarrhées (manque d'hygiène en routine, vie communautaire, promiscuité, etc.), a été l'absence d'une antibiothérapie de première intention adaptée [6]. En effet, l'antibiogramme a montré une sensibilité variable au cotrimoxazole et une résistance à l'ampicilline et à la tétracycline qui ont été malheureusement le plus souvent utilisés à la place de la ciprofloxacine non disponible à la Pharmacie régionale d'approvisionnement [7]. L'identification de SD1 parmi les souches de Shigella isolées laisse penser que cette souche est bien à l'origine d'une partie des cas observés. Il est d'ailleurs décrit que SD1 est la seule souche à l'origine d'épidémies de dysenterie [8, 9]. Cependant, l'isolement de plus en plus fréquent de S. flexneri (notamment au Sénégal et en Afrique du Sud [2, 10]) mériterait une investigation quant à son éventuelle participation active lors des épidémies de shigelloses, comme cela a été le cas en France en 1998 pour S. Sonnei [11]. Une étude plus approfondie du rôle joué par S. flexneri mériterait d'être conduite à l'échelle nationale.

CONCLUSION

Remerciements

Nos remerciements vont à l'ensemble des personnes ayant participé à la réalisation de cette enquête, et tout particulièrement aux infirmiers chefs de poste, aux superviseurs et aux enquêteurs de la zone d'étude de Niakhar. Nos remerciements vont également à l'Institut Pasteur de Dakar pour l'analyse bactériologique, à A. Marra et O. Ndiaye pour la gestion des données.

REFERENCES

1. Anonyme. Bull Épidémiol Sénégal 1999 ; 7 : 9.

2. Diallo A, Diop MB, Guèye EMM, Etard JF. Investigation d'une épidémie de shigellose en zone rurale au Sénégal, 1999. Bull Épidémiol Sénégal 2000 ; 10 : 7-8.

3. Paquet C, Leborgne P, Sasse A, Varaine F. Une épidémie de dysentérie à Shigella dysenteriae Type 1 dans un camp de réfugiés au Rwanda. Cahiers Santé 1995 ; 5 : 181-4.

4. Wittenberg DF. The spread of Shigella dysenteriae Type 1 in Africa. Jpn J Med Sci Biol 1998 ; 51 (suppl. 1) : S36-42.

5. Roquet D, Diallo A, Kodio B, Daff BM, Fenech C, Etard JF. L'épidémie de choléra de 1995-1996 au Sénégal : un exemple de démarche de géographie de la santé. Cahiers Santé 1998 ; 8 : 421-8.

6. Laureillard D, Paquet C, Malvy D. Ciprofloxacine de la dysenterie à Shigella dysenteriae de type 1 lors d'une épidémie chez les réfugiés rwandais à Goma in 1994. Cahiers Santé 1998 ; 8 : 303-5.

7. Bogaerts J, Verheagen J, Munyabikali JP, et al. Antimicrobial resistance and serotype of Shigella isolates in Kigali, Rwanda (1993) : increasing frequency of multiple resistance. Diagn Microbiol Infect Dis 1997 ; 28 : 165-71.

8. Pillay DG, Karas AJ, Sturn AW. An outbreak Shiga bacillus in KwaZulu/Natal, South Africa. J Infect 1997 ; 34 : 107-11.

9. Rollins NC, Wittenberg DF, Coovadia HM, Pillay DG, Karas AJ, Sturn AW. Epidemic Shigella dysenteriae type 1 in Natal. J Trop Pediatr 1995 ; 41 : 281-4.

10. Thurston H, Stuart J, McDonnell B, Nicholas S, Cheasty T. Fresh orange juice implicated in outbreak of Shigella flexneri among visitors South African game reserve. J Infect 1998 ; 36 : 350.

11. Empana JP, Perrin MD, Pilon B, Ilef D. Épidémie de shigellose à Shigella sonnei, Institut médico-éducatif spécialisé de Proisy, 1999. XVes Journées scientifiques Epiter, septembre 1999.


 

About us - Contact us - Conditions of use - Secure payment
Latest news - Conferences
Copyright © 2007 John Libbey Eurotext - All rights reserved
[ Legal information - Powered by Dolomède ]