Les polyomavirus humains nouvellement identifiés chez l’homme

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Figure 1 Représentation schématique des relations phylogénétiques entre les différents polyomavirus animaux et humains.Les séquences complètes de différents polyomavirus ont été alignées avec le programme Clustal-W. La construction de la matrice se fait par DNAdist du package PHYLIP. 1000 bootstrap avec addition aléatoire de séquences ont été pris en compte pour l’arbre consensuel L’arbre est construit par la méthode de Neighbor-Joining et visualisé à partir du logiciel Treeview. Les numéros d’accession des séquences complètes représentées dans cet arbre sont les suivants : Simian virus 40 (NC001669) ; Baboon polyomavirus (NC007611) ; B-lymphotropic polyomavirus (M30540) ; Squirrel monkey polyomavirus (NC009951) ; Bovine polyomavirus (NC001442) ; Hamster polyomavirus (NC001663) ; Murine polyomavirus (NC001515) ; Murine pneumotropic polyomavirus (NC001505) ; Finch polyomavirus (NC007923) ; Budgerigar fledgling polyomavirus (NC004764) ; Goose hemorrhagic polyomavirus (NC004800) ; Crow polyomavirus (NC007922) ; KI polyomavirus (EF127908) ; WU polyomavirus (NC009539) ; JC polyomavirus (NC001699) ; BK polyomavirus (NC001538) et Merkel cell polyomavirus (NC010277).