Les virus influenza présentent à leur surface deux glycoprotéines, l’hémagglutinine (HA) et la neuraminidase (NA), possédant des fonctions à la fois complémentaires et antagonistes. Ces deux glycoprotéines sont des cibles antigéniques majeures et participent également, via l’équilibre entre leurs deux fonctions, à l’évolution et l’adaptation des souches chez l’hôte humain. Cet équilibre est désigné sous le terme de balance HA-NA. Un déséquilibre de la balance HA-NA module les capacités de multiplication et de transmission des virus influenza. De plus, la balance HA-NA constitue probablement un facteur limitant le franchissement de la barrière d’espèce par les virus influenza. Ce contexte justifie que cette balance HA-NA soit précisément étudiée, afin de mieux comprendre l’émergence de virus pandémiques et l’établissement de certains virus saisonniers. Cette revue détaille le concept de la balance HA-NA, ainsi que les méthodes d’étude de cette balance. Au regard des pandémies de 1918 et 2009 impliquant des virus influenza A(H1N1), l’évolution de ces virus en particulier et de leur balance fonctionnelle sont décrites ici.